Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SYPL1Q16563 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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