Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ZIC1Q15915 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ZIC1Q15915 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms