Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VPS72Q15906 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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