Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
PTPRKQ15262 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTPRKQ15262 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms