Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTPRRQ15256 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRRQ15256 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms