Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMCO1Q147U7 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SMCO1Q147U7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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