Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SEMA3AQ14563 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
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