Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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GBX1Q14549 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
GBX1Q14549 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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