Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PKP1Q13835 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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