Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SPTAN1Q13813 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPTAN1Q13813 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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