Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC27■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC27■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
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SHROOM2Q13796 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SHROOM2Q13796 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
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