Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CUL4BQ13620 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CUL4BQ13620 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms