Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
TCIRG1Q13488 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCIRG1Q13488 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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