Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PRDM2Q13029 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRDM2Q13029 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
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