Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CSTF3Q12996 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CSTF3Q12996 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CSTF3Q12996 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CSTF3Q12996 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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CSTF3Q12996 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSTF3Q12996 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSTF3Q12996 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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