Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HSPB3Q12988 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms