Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C2orf54Q08AI8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms