Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PUDPQ08623 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms