Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SCN1BQ07699 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SCN1BQ07699 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms