Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TFF3Q07654 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms