Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms