Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FMODQ06828 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FMODQ06828 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FMODQ06828 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms