Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GBE1Q04446 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GBE1Q04446 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms