Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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IFITM3Q01628 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IFITM3Q01628 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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