Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF9Q00978 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms