Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLTCQ00610 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLTCQ00610 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms