Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CDK3Q00526 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CDK3Q00526 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms