Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCL7P80098 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCL7P80098 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms