Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNRPNP63162 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SNRPNP63162 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms