Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FBXW4P57775 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms