Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RIPK4P57078 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RIPK4P57078 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms