Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AQP4P55087 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AQP4P55087 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AQP4P55087 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AQP4P55087 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AQP4P55087 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AQP4P55087 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AQP4P55087 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AQP4P55087 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AQP4P55087 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AQP4P55087 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AQP4P55087 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AQP4P55087 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
AQP4P55087 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AQP4P55087 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
AQP4P55087 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
AQP4P55087 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
AQP4P55087 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AQP4P55087 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AQP4P55087 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AQP4P55087 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
AQP4P55087 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
AQP4P55087 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms