Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms