Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ARFIP1P53367 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ARFIP1P53367 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms