Protein–RNA interactions for Protein: P52747

ZNF143, Zinc finger protein 143, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF143P52747 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZNF143P52747 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF143P52747 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms