Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LHX2P50458 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX2P50458 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms