Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CRIP1P50238 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms