Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPL35P42766 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPL35P42766 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
RPL35P42766 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
RPL35P42766 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
RPL35P42766 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
RPL35P42766 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
RPL35P42766 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms