Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GPC1P35052 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC1P35052 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC1P35052 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC1P35052 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC1P35052 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
GPC1P35052 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms