Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHC1P29353 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHC1P29353 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHC1P29353 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHC1P29353 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHC1P29353 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms