Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GTF2E1P29083 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms