Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GADD45AP24522 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GADD45AP24522 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms