Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
VAMP1P23763 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
VAMP1P23763 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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