Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFNA1P20827 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFNA1P20827 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms