Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMY2BP19961 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMY2BP19961 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMY2BP19961 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AMY2BP19961 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms