Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
PDE6GP18545 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PDE6GP18545 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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