Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
EGR1P18146 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EGR1P18146 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EGR1P18146 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms