Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTLA4P16410 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms