Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TOP2AP11388 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TOP2AP11388 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms