Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAMC1P11047 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms